از مرحوم آیت‌الله شاه‌آبادی (قدس سره) آثار متعددی به جا مانده است که البته برخی از آن‌ها هنوز به زیور چاپ آراسته نشده است. این روزها در قم برخی دست‌نوشته‌ها و آثاری از ایشان یافت شده است که گروهی از فضلا در حال بررسی و کار بر روی آن‌ها هستند. همچنین آثاری نیز پیرامون شخصیت عرفانی، فلسفی ایشان نگاشته شده است.کتابهای «شذرات المعارف»، «رشحات البحار»، رساله عملیه ایشان با نام «مفتاح السعاده»، حاشیه فقهی ایشان بر کتاب «نجاة العباد» کتبی است که به به قلم ایشان نگاشته شده و در زمان حیات ایشان نیز چاپ شده است.
۱. شذرات المعارف
دیدگاه‌های اخیر